要延长柴油机的使用寿命，在使用过程中，就要加强空气滤清器、机油滤清器和燃油滤清器这三种滤清器的保养，充分发挥它们的作用。
空气滤清器在安装时不可漏装、反装或错装各密封垫圈及橡胶连接管，并保证各按嵌处的严密性。使用的纸质集尘杯空气滤清器，每工作50-100小时，要清除尘土1次，可用软毛刷将表面尘土刷掉，若工作时间超过500小时或已损坏，就应及时更换。使用油浴式空气滤清器，每工作100-200小时，应用清洁的柴油清洗滤芯，并更换其中的机油，若滤芯已破碎，就需立即更换，并注意在使用中，按规定添加机油。
机油滤清器在柴油机使用中如不及时保养，滤芯堵塞、机油压力增加，安全阀打开，润滑油直接流入主油道，会加剧润滑表面的磨损，影响柴油机的使用寿命。因此，机油滤清器每工作180-200小时，就要清洗1次，发现破损，应立即更换，以防止杂质进入润滑表面。柴油机换季使用，还应清洗曲轴箱和各润滑表面，方法是用机油、煤油和柴油混合后作洗涤油，可在机油放出后加入洗涤油清洗，然后，柴油机低速运转3-5分钟，再放尽洗涤油，加入新机油。
燃油供给系统中的各种燃油滤清器，每工作100-200小时，就应清除杂物1次，并对油箱和各输油管道进行全面清洗。在清洗滤芯和密封件时，应特别仔细，发现破损，需及时更换。在季节过渡换油时，应对整个燃油供给系统的各零部件进行清洗。使用的柴油，应符合季节要求，并需经48小时的沉淀净化处理。
